洁净室风量大，空调系统风压高，运行时间厂，因此它的能耗比普通建筑消耗的更多，所以在设计过程中应全面考虑节能问题。为维持净化车间要求温度和相对湿度，需对送风进行必要的热、湿处理（冷却、去湿、加热、加湿），因此也必须要向空调净化系统供冷供热，供蒸汽就要消耗大量能量。
为保证净化车间洁净度，温度、湿度等参数，必须往净化车间中送入大量空气，送风风机和供水水泵等动力设备也要消耗能量。根据前面所说的供冷、供热、供蒸汽消耗能量以及送风、送水设备消耗电量都会随着洁净级别的升高，能量消耗也会随之加大。
在净化车间冷负荷中，主要负荷是新风冷负荷，消除工艺设备、工艺过程产热的冷负荷、抵消风机、水泵发热冷负荷，这三项负荷占总冷负荷的90%以上；而围护结构、照明、作业人员，这三项冷负荷不足总冷负荷的10%。