净化空调机房的面积不足或位置不合理的问题在很多ICU净化工程中都出现过，有的项目的设备机房面积过小，导致后期布置净化机组较困难，出现机组空间不够或勉强放下机组却没有空间检修的情况。
也有的项目未设置专用的机房，将设备布置在吊顶中，这对于普通空调来说问题不大，但净化空调维护的地方较多，仅过滤器一项就需经常更换，这样做给后期的设备维护带来了相当大的不便。
因此，大型的手术部净化设备较多，应设置专用的设备层，设备层宜设置在手术部上方，也有的项目将设备层设置在手术部下方，ICU净化工程中，这样做的优点是减少了机组振动噪声对ICU病房的影响，但由于各风系统管道需要从下方穿到ICU净化工程吊顶，占用了ICU净化工程较多的建筑面积，也不建议采用。
其次，设备机房与ICU病房不应间隔过远，有的项目设备机房没有设置在手术部正上方，而是设置在了相邻楼的裙房中，这样做不仅增大了风管的长度，增加了漏风量，也增大了系统的阻力，需设置较大压头的风机，增大了系统能耗，所以，ICU净化工程的前期应与建筑专业协调，方案设计时就确定好设备机房的位置。
各设备的布置宜整齐划一，不应横竖混乱布置，否则会使本来就狭小的空间更显凌乱。其次，ICU净化工程中，机组的检修侧、水管接管方向、强电自控箱的位置应设置在检修通道一侧，以便于检修。
当空气中的湿度过低时，干燥的空气容易使人身体内的水分散失较快，导致皮肤干燥，易引起上呼吸道粘膜感染，患上感冒。
根据相关文件，科学研究表明，当空气湿度高于65％或低于38％时，细菌繁殖最快。当相对湿度在45%～55%时，病菌死亡较快。因此，ICU净化工程中，夏季湿度高时需除湿，在冬季湿度过低时，应在净化空调系统中设置加湿系统。普通空调中，湿膜加湿由于系统简单、造价运行管理成本较低而广泛应用，但由于湿膜加湿器表面有水，很容易滋生细菌，因此不应在医院净化空调中应用。
另外，在ICU净化工程中的空调机房的机组布置问题也需引起注意，净化机组应根据建筑平面均匀布置，应考虑机房与下层手术部的关系，各机组的距离不应过近，应预留足够的检修空间。设备层的整体布局应合理，预留主要的检修通道，检修通道宽度宜大于1.5m，高度大于1.8m。