净化车间的施工要求极为严格，即便再严格，也会有很多小问题出现，对于影响净化车间的因素我们总结出了四点：
外部依附于的微生物菌种，房屋表面，包含外界设备，以及器皿內外都可能滋长微生物菌种。因而，在制取前，需对药物制取设备进行清洁工作。
针对身体肌肤的基础代谢，衣着上坠落的化学纤维，棉绒，头发这些都可能导致净化车间內部空气受到污染，在进到试验室前，需对自身清理及专业的服饰配搭。
空气中有很多微生物菌种和病菌，在空气中，环境污染来源人，及尾气排放，工业污染，针对净化车间而言，气体中含有危害成分无法完全避免。
在净化车间施工建设中，水非常普遍，针对微生物菌种在纯净水中的生长发育有难度系数，即便经过非常严格的过滤或清洁后，其中依然存有可溶成份，该类微生物菌种就会为此得到滋生。