对于大面积、集中和同时使用或噪声控制和振动控制严格清洗窒息，应使用集中净化空调系统。相反，可以使用分散式空调系统。大型净化车间还可以结合使用新风处理和分散式净化空调装置。当需要满足洁净室、正空气量和排气量的新风量时，空调系统应充分利用回风。只有在加工过程中产生大量有害物质时，才能使用直流式空调系统，局部处理不能保证卫生要求或损坏其他过程。
洁净室应在下列条件下单独设置清洁空调系统：
1.层流洁净室和湍流洁净室
2.末端过滤器的不同洁净室
3.洁净室和一般空调房
4.运行班次或使用不同时间的洁净室
5.当洁净室面积过大或房间过大时，应分为几个净化空调系统，方便调整、回风管布置和风量、压力;
6.生产过程要求空调系统不能一起使用。
通常不建议为空调系统安装消声器。应采取其他综合措施，以满足洁净室降噪的要求。当必须使用消声器时，应使用由不产生灰尘且不易积聚的结构制成的消声器和良好的吸音材料。
在洁净室中安装局部排气系统应考虑以下几点：
1.排气系统不应穿过两个清洁空调系统;
2.局部排气系统应采取措施防止空气回流。中间排放过滤器或止回阀可以安装在排气系统上。
3.局部排气系统应采取降噪措施。设置消声器时，应将其放在风扇的吸气部分上。
4.应注意有害物质的排放，使其符合国家规定的排放标准。空调系统中的鼓风机、回风机和排风机应互锁。联锁顺序如下：当系统开启时：首先打开鼓风机，然后将风扇和排风扇驱回：当系统关闭时：首先关闭排气扇并返回风扇，然后关闭鼓风机。